回	年度	出場校	回戦	勝負	スコア	相手校	都道府県名
７６	１９９４	長崎北陽台	１回戦	〇	２―０	関東一	（東東京）
			２回戦	〇	４―１	宿　毛	（高　知）
			３回戦	〇	３―２	中　越	（新　潟）
			準々決勝	×	５―14	樟　南	（鹿児島）
７７	１９９５	長崎日大	１回戦	×	２―４	佐久長聖	（長　野）
７８	１９９６	波佐見	２回戦	〇	４―２	秋田経大付	（秋　田）
			３回戦	〇	８―５	宇都宮南	（栃　木）
			準々決勝	×	６―７	熊本工	（熊　本）
７９	１９９７	長崎南山	１回戦	×	４―６	豊田大谷	（愛　知）
８０	１９９８	長崎日大	２回戦	×	１―４	帝　京	（東東京）
８１	１９９９	長崎日大	１回戦	〇	５―０	日大三	（西東京）
			２回戦	〇	６―５	明徳義塾	（高　知）
			３回戦	×	２―３	滝川二	（兵　庫）
８２	２０００	長崎日大	１回戦	〇	５―３	富山商	（富　山）
			２回戦	〇	３―１	酒田南	（山　形）
			３回戦	〇	６―２	徳島商	（徳　島）
			準々決勝	×	７―８	育　英	（兵　庫）
８３	２００１	波佐見	１回戦	×	１―４	佐野日大	（栃　木）
８４	２００２	海星	１回戦	〇	８―１	日本文理	（新　潟）
			２回戦	×	０―３	智弁学園	（奈　良）
８５	２００３	長崎日大	１回戦	×	４―５	静　岡	（静　岡）